国内刊号:37-1390/R
国际刊号:1671-7554
发布日期:
作者:杨春桃,左玉
单位:1.泉州医学高等专科学校口腔医学院, 福建 泉州 362011;2.桂林医科大学附属口腔医院口腔修复科, 广西 桂林 541004
关键词:MMP1基因,MMP8基因,MMP9基因,慢性牙周炎,孟德尔随机化,单核苷酸多态性,因果关系,
目的 采用两样本孟德尔随机化(Mendelian randomization, MR)方法探索MMP1/MMP8/MMP9基因与慢性牙周炎是否存在因果关系。 方法 使用FinnGen R10(于2023年12月公开发布)慢性牙周炎(K11_PERIODON_CHRON)全基因组关联研究(genome-wide association study, GWAS)汇总数据,选择与暴露基因(MMP1/MMP8/MMP9)显著相关且符合标准的单核苷酸多态性作为工具变量,以MMP1/MMP8/MMP9基因作为暴露变量,慢性牙周炎作为结局变量。采用MR-Egger回归、加权中位数、逆方差加权、简单模式、加权模式进行MR分析。用Cochrans Q检验和MR-Egger回归进行异质性检测。用MR-Egger截距和MR-PRESSO分析方法评估水平多效性。并用leave-one-out分析方法评估MR分析结果的整体稳定性。使用比值比(odds ratio, OR)和95%置信区间(confidence interval, CI)来量化MMP1/MMP8/MMP9基因对慢性牙周炎的因果关系。 结果 在数据集ebi-a-GCST90012033(P=0.005, OR=0.955, 95%CI=0.924~0.986)和数据集eqtl-a-ENSG00000196611(P=0.048, OR=0.912, 95%CI=0.832~0.999)中,基于逆方差加权分析的结果提示MMP1基因预测的表达水平与慢性牙周炎风险之间存在显著的因果关系。在数据集prot-a-1920(P=0.087, OR=0.993, 95%CI=0.985~1.001)和数据集eqtl-a-ENSG00000118113(P=0.883, OR=0.992, 95%CI=0.887~1.109)中,基于逆方差加权分析的结果提示MMP8基因预测的表达水平与慢性牙周炎风险之间不存在显著的因果关系。在数据集prot-a-1921(P=0.450, OR=0.985, 95%CI=0.948~1.024)中,基于逆方差加权分析的结果提示MMP9基因预测的表达水平与慢性牙周炎风险之间不存在显著的因果关系。但在数据集eqtl-a-ENSG00000100985(P=2.405×10-5, OR=1.123, 95%CI=1.064~1.184)中,基于逆方差加权分析的结果提示MMP9基因预测的表达水平与慢性牙周炎风险之间存在显著的因果关系。 结论 从遗传学层面,MR分析结果支持MMP1、MMP9基因在慢性牙周炎发病机制中可能发挥致病作用。从病因学层面,MMP1、MMP9基因只是慢性牙周炎的致病因素之一。
来源:2025年第11期
《山东大学学报(医学版)》期刊编辑部