山东大学学报(医学版)

作者：王珊,刘伟,冯强,范莹莹,刘海霞,段延华,温红玲,焦伯延

单位：1.济宁市疾病预防控制中心, 山东 济宁 272008;2.山东大学公共卫生学院, 山东 济南 250100;3.济宁市传染病预防控制重点实验室, 山东 济宁 272008;4.济宁市任城区疾病预防控制中心, 山东 济宁 272103

关键词：手足口病,肠道病毒,柯萨奇病毒A组6型,全基因组分析,

基金：山东省医药卫生科技发展计划项目(202112060725);山东省学校卫生协会科研课题(SDWS2022046)

目的 分析2021年济宁市柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6, CVA6)流行特点和全基因组特征,为手足口病的防控提供依据。 方法 采用反转录实时荧光定量PCR(reverse transcription quantitative real-time PCR,RT-qPCR)法对2021年济宁市11县市区采集的手足口病病例样本进行CVA6核酸检测;将CVA6阳性样本接种到人横纹肌瘤细胞进行病毒的细胞培养,提取病毒核酸,并采用二代测序技术进行全基因组测序;采用MEGA 7.0.14、RNAfold、NetPhos 3.1、NetNGlyc 1.0和GPS Lipid生物信息学软件进行相似性、构建内部核糖体进入位点(internal ribosome entrysite, IRES)二级结构、磷酸化位点、糖基化位点和脂酰化位点分析。 结果 核酸检测结果显示,2021年济宁市手足口病肠道病毒阳性病例中CVA6占比为35.79%(97/271)。全基因组测序结果显示,3株CVA6与原型株Gdula的核苷酸同源性为80.69%~80.95%,多聚蛋白氨基酸同源性为94.83%~94.92%。生物信息学分析结果显示,在进化树上,3株CVA6均位于D3a进化分支,但位于不同的进化簇。与原型株Gdula相比,5’UTR的IRES区共发生了7处核苷酸变异,VP1抗原表位发生了Q98L、G160S变异,VP1受体结合位点发生了S194T变异,3D聚合酶活性位点发生了T308S、L342S和K346R变异。此外编码蛋白的磷酸化位点、糖基化位点和脂酰化位点均发生多处位点的变异。 结论 2021年济宁市手足口病病例中CVA6是主要病原体,向适应宿主的方向进化,应加强对CVA6的监测和防控。

来源：2025年第9期

《山东大学学报(医学版)》期刊编辑部

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