山东大学学报(医学版)

北大核心,CA,JST,WJCI,

国内刊号:37-1390/R

国际刊号:1671-7554

山东大学学报(医学版)杂志2023年第4期:利用数据库信息分析NAMPT与肝癌的病理特征和免疫浸润的关联性

发布日期:

作者:常晴,刘佳,曲爱林,杨咏梅

单位:山东大学齐鲁医院 1.检验医学中心;2.基础医学研究中心, 山东 济南 250012

关键词:烟酰胺磷酸核糖转移酶,肝细胞癌,生物信息学,免疫浸润,肿瘤免疫微环境,

基金:国家自然科学基金(82102481);山东省自然科学基金(ZR2021QH206)

目的 分析烟酰胺磷酸核糖转移酶(NAMPT)在肝细胞癌(HCC)中的表达,并研究其与肝癌患者病理特征及免疫浸润的关系。 方法 利用TIMER数据库获得NAMPT在HCC中的表达数据。通过UALCAN数据库分析NAMPT表达与血清甲胎蛋白(AFP)之间的相关性。从TCGA-LIHC中下载肝癌转录组RNA-Seq数据,提取NAMPT和免疫相关分子 mRNA表达量。利用估计算法和单样本基因集富集分析(ssGSEA),评估NAMPT高低表达组间免疫成分、基质成分的数量和免疫细胞浸润丰度及计算免疫相关分子表达有无差异;分析NAMPT表达与免疫细胞浸润的关联性。 结果 TIMER数据库显示,NAMPT mRNA在HCC中的表达低于癌旁组织(P<0.05)。UALCAN数据库检测发现,NAMPT表达和血清AFP呈负向低度相关(r=-0.464, P<0.05)。基质细胞占比、免疫细胞占比和肿瘤细胞纯度在NAMPT高低表达组间存在统计学差异(P<0.05)。ssGSEA分析发现,20种免疫细胞在NAMPT高表达组中的浸润程度高于NAMPT低表达组(P<0.05)。免疫相关分子NKG2D、CD40、FAS、ELANE、PDL1、PDL2在两组中的表达差异有统计学意义(P<0.05)。TIMER数据库分析发现,NAMPT的表达与巨噬细胞(r=0.125, P=0.021)、中性粒细胞(r=0.284, P<0.001)和树突状细胞(r=0.131, P=0.016)浸润呈正向低度相关,与肿瘤纯度呈负向低度相关(r=-0.137, P=0.011)。 结论 NAMPT与临床病理参数具有一定相关性,并能在一定程度反映肝癌患者免疫微环境的状态。本研究为鉴别肝癌免疫治疗获益人群提供了新的线索。

来源:2023年第4期

《山东大学学报(医学版)》期刊编辑部

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