山东大学学报(医学版)

作者：贺士卿,李皖皖,董书晴,牟婧怡,刘宇莹,魏思雨,刘钊,张家新

单位：1.徐州医科大学, 江苏 徐州 221004;2.徐州医科大学附属医院甲乳外科, 江苏 徐州 221004

关键词：乳腺癌,焦亡,免疫,预后,预测模型,

基金：国家自然科学基金(16611622);中国乳腺肿瘤青年学者科研项目(CYBER-2021-010);徐州市重点研发计划(KG21218)

目的 探究焦亡相关差异表达基因(DEGs)在乳腺癌中预后价值并构建预后风险模型。 方法 从癌症基因组图谱(TCGA)和肿瘤基因表达数据库(GEO)官网下载乳腺癌的基因测序、临床数据,筛选焦亡相关DEGs。将乳腺癌患者进行聚类分析。在TCGA队列中以最小绝对收缩和选择算子(LASSO)方法建立模型。利用Kaplan-Meier生存曲线、受试者工作特征曲线(ROC)、单因素及多因素Cox回归独立预后因素分析等评价该模型。GEO队列为验证集。通过GO、KEGG、ssGSEA分析风险DEGs的富集情况。 结果 筛选出焦亡相关DEGs,聚类分析可见C2组总生存期(OS)延长,差异有统计学意义(P=0.020)。该模型K-M生存分析显示,高风险组OS缩短(TCGA队列中P<0.001,GEO队列中P=0.018)。ROC曲线下面积(AUC)表明该模型具有一定预测能力。单因素、多因素Cox回归分析表明,年龄、M、N分期和风险评分为OS的独立预测因子。GO、 KEGG富集与ssGSEA分析证实了风险相关DEGs与免疫炎症因子和通路有关。 结论 本研究构建了由9个焦亡相关基因组成的乳腺癌预后风险模型,为乳腺癌患者的风险预后评估提供了参考。

来源：2022年第8期

《山东大学学报(医学版)》期刊编辑部

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