山东大学学报(医学版)

北大核心,CA,JST,WJCI,

国内刊号:37-1390/R

国际刊号:1671-7554

山东大学学报(医学版)杂志2022年第5期:基于单细胞转录组测序数据分析胃癌调节性T细胞特征

发布日期:

作者:高惠茹,杜甜甜,王允山,杜鲁涛,王传新

单位:1. 山东大学第二医院检验医学中心, 山东 济南 250033;2. 山东省肿瘤标志物检测工程实验室, 山东 济南 250033

关键词:胃癌,单细胞RNA测序,细胞组成,调节性T细胞,细胞互作,

基金:山东省重点研发计划(2019GHZ003);山东大学临床研究项目(2020SDUCRCA002)

目的 探究胃癌及胃正常组织的细胞组成,分析调节性T细胞在胃癌及胃正常组织中的差异。 方法 下载胃癌单细胞转录组测序数据并进行质控、降维聚类及细胞注释,提取调节性T细胞进行差异基因、轨迹、GSVA及细胞相互作用分析,明确正常组织和肿瘤组织来源的调节性T细胞特征。 结果 在细胞组成方面,不同患者、不同样本类型之间存在较大异质性。与正常组织相比,调节性T细胞在肿瘤组织占比更高,与细胞死亡、细胞周期等通路相关。细胞相互作用分析显示,肿瘤组织中调节性T细胞与其他细胞相互作用频率更低、强度更大,互作模式具有显著变化。 结论 调节性T细胞主要在胃癌肿瘤微环境中存在。胃癌及胃正常组织中调节性T细胞在数量、功能等方面存在显著差异。

来源:2022年第5期

《山东大学学报(医学版)》期刊编辑部

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