山东大学学报(医学版)

作者：王艳,张宇卉,胡耐博,滕广帅,周圆,白洁

单位：1. 天津医科大学第二医院血液科, 天津 300211;2.中国医学科学院血液病医院 中国医学科学院血液学研究所 实验血液学国家重点实验室, 天津 300020

关键词：急性髓系白血病,单细胞测序,骨髓微环境,免疫细胞,生物信息,

基金：国家自然科学基金(81770128,81970120)

目的 通过单细胞测序技术分析急性髓系白血病(AML)患者骨髓免疫微环境的组成情况,探讨不同类型免疫细胞的不同亚群在AML发生发展中的作用。 方法 检索基因表达数据库(GEO)中符合条件的scRNA-seq数据集(GSE116256),利用R语言的Seurat包对数据进行处理,利用SingleR包并参考既往研究对细胞亚群进行注释,计算不同类型免疫细胞的比例,寻找AML患者与正常对照组存在差异的细胞亚群并计算它们的差异基因(DEGs),对DEGs进行基因本体功能注释(GO)和京都基因与基因组百科全书富集分析(KEGG),明确存在差异的细胞亚群在AML疾病进程中的作用。 结果 与正常对照组相比, AML患者的造血祖细胞、单核细胞、NK/T细胞、树突状细胞和B细胞的亚群比例均发生不同程度改变。通过对差异基因进行功能富集发现,AML的单核细胞、树突状细胞、B细胞以及T细胞的增殖、分化、免疫调控及对肿瘤细胞的杀伤功能出现不同程度损伤。 结论 AML患者与健康人的免疫微环境存在较大差异,这些差异可能与AML的发生发展关系密切。

来源：2021年第10期

《山东大学学报(医学版)》期刊编辑部

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