山东大学学报(医学版)

北大核心,CA,JST,WJCI,

国内刊号:37-1390/R

国际刊号:1671-7554

山东大学学报(医学版)杂志2021年第7期:利用数据库信息构建乳腺癌免疫关联lncRNAs风险评估模型

发布日期:

作者:李皖皖,周文凯,董书晴,贺士卿,刘钊,张家新,刘斌

关键词:乳腺癌,长链非编码RNA,免疫,预后,预测模型,

目的 筛选乳腺癌中免疫关联长链非编码RNA(lncRNA),并构建乳腺癌预后风险评估模型,探索预后相关因素。 方法 从UCSC Xena(https://xena.ucsc.edu/)、TCGA、immport(https://www.immport.org/home)官网分别下载乳腺癌患者的测序数据、临床信息以及免疫基因集,并将这些数据进行整理和清洗,最终得到乳腺癌免疫关联lncRNA表达矩阵及临床信息。利用单因素Cox和多因素Cox回归分析筛选出与预后相关的免疫关联 lncRNA,用于构建预后风险评分。根据风险评分的中位数,将患者分为高风险组和低风险组,利用Kaplan-Meier(K-M)生存分析、受试者工作特征曲线(ROC)分析及独立预后因素评估对模型进行评价,并将此模型联合其他临床因素构建列线图,对乳腺癌患者进行生存率预测。 结果 最终确定10个免疫关联 lncRNAs 用来构建风险评分模型;高风险组较低风险组预后差;风险评分可作为乳腺癌患者的独立预后因素;列线图的C指数(CI)为0.751,校准图显示预测值与实际观测值一致性较好。 结论 由10个免疫关联lncRNAs 组成的风险评分模型可用于评估乳腺癌患者的预后,由此建立的列线图可进一步预测乳腺癌患者的生存率。

来源:2021年第7期

《山东大学学报(医学版)》期刊编辑部

查看山东大学学报(医学版)杂志2021年第7期

联系我们

  • 地址:山东省济南市历城区山大南路27号
  • 电话:0531-88366918
  • E-mail:xbyxb@sdu.edu.cn

咨询工作人员